兩性聚丙烯酰胺的結構是以丙烯酰胺單體為主要結構單元，通常在丙烯酰胺單元之間插入其他帶有電荷基團的單體單元，或是在丙烯酰胺單元上的酰胺基團上接入其他結構，或是通過改性反應將酰胺改變為電荷基團。

根據聚合物分子中正負電荷基團的分布，兩性聚電解質一般可分為兩大類：隨機性兩性聚電解質與甜菜堿型兩性聚電解質，結構示意見圖1。

隨機性兩性聚電解質是指正負電荷基團分別在不同的單體上，而正負電荷單體位于同一單體上的聚合物則稱為甜菜堿型兩性聚合物。

根據分子鏈上正負電荷基團數量是否相等可分為對稱性兩性聚電解質和非對稱性兩性聚電解質，正負電荷基團數量相等為對稱型，反之則為非對稱型。

此外，根據單體單元在溶液中電離性質還可將兩性聚合物分為強酸弱堿型、強堿弱酸型、強酸強堿型和弱酸弱堿型；

根據單體單元序列可分為隨機型、交替型、鑲嵌型和接枝型。

針對不同的應用領域、應用環境和應用目的，選擇使用的兩性聚丙烯酰胺類型不同。目前，在造紙工業中兩性聚丙烯酰胺研究和使用較多的是非對稱隨機型。